Поддерживающую форму обрезку проводят на сформированном бонсае в конце зимы-начале весны. Цель такой обрезки — сохранить форму дерева и предотвратить загущение кроны. Прежде всего удаляют часть ветвей по периферии кроны, чтобы освободить место для прироста следующего года. Затем вырезают или укорачивают трущиеся ветви, а также ветви, нарушающие форму. На хвойных деревьях растущие вверх ветви разрушают облик зеленого облака из листвы, поэтому их нужно удалять. Хвойные растения следует обрезать особенно осторожно: укороченная безлистная ветвь не даст прироста. Каждые несколько лет необходимо удалять часть крупных ветвей, чтобы дать возможность развиваться новым побегам. Крону обрезают острым инструментом, для мелких ветвей применяют ножницы, для более толстых — секатор или кусачки. Крупные раны замазывают садовым варом.

   Ветви обрезают обычно осенью, вырезая ненужные ветви на кольцо. Секатором, маленькой садовой пилой или кусачками обрезают ветку, оставляя короткий пенек, затем кусачками срезают пенек на кольцо; срез замазывают варом.

   Формирующую обрезку проводят в середине лета на лиственных деревьях. Ее цель — стимулировать отрастание новых сильных ветвей. Ствол или крупную ветку укорачивают до нужной длины, осенью часть отросших ниже среза побегов удаляют.